《有巢氏文存/有巢氏文化研究》为《有巢氏文化研究》丛书之一，分三编：上编为典籍类编，中编为方志类编，下编为艺文类编。《有巢氏文存/有巢氏文化研究》系统辑录编选自先秦至现代的关于记载、评述、歌颂始祖有巢氏、皇祖有巢氏、仁祖巢父的业绩、功德和历史贡献的典籍、方志和艺文作品，并进行版本比较、文字订正、意旨诠释，可供学术文化界研究与参考。

总序一
总序二
中华文明探源：从五千年走向一万年——写在《有巢氏文化研究》丛书前面的话
前言
凡例
上编 典籍类编
一、先秦时期著作
1 太公六韬
2 周易
3 世本
4 逸周书
5 三坟
6 墨子
7 容成氏
8 庄子·盗跖
9 庄子·杂篇
10 乾坤凿度
11 韩非子
二、汉晋六朝著作
12 史记
13 林邑记
14 遁甲开山图
15 河图
16 法言·问明卷
17 礼记
18 春秋纬·有巢
19 春秋纬-古皇
20 汉书
21 说文解字
22 战国策
23 丹壶书
24 琴操
25 潜夫论
26 后汉书
27 始学编
28 与阮籍书
29 古史考
30 圣贤高士传
31 太古河图代姓纪
32 逸士传·序
33 逸士传·被衣王倪啮缺传
34 逸士传·巢父许由传
35 帝王世纪
36 博物志
37 许巢论
38 抱朴子
……

中编 方志类编
下编 艺文类编
后记