《日本针灸医籍十六种》主要精选自日本江户时代以来的针灸医学著作16种，按成书年代排序，涉及影响较大的名家名著、不同流派的针灸著作、独具特色的针灸专著、短小实用的针灸小书及日本传来针灸著作5类。所选书种形式多样，内容丰富，在一定程度上反映出日本针灸医学的成就特色及发展创新，具有较高的实用价值和研究价值。
《大明琢周针法一轴》-日本针灸学派匹地流的代表著作，内容短小精当，便捷实用，承载着匹地流针术的精华，是日本针医通过实践对中国刺针技术的提炼和升华。
《杉山真传流》——阐明了日本著名针灸流派杉山流、杉山真传流的针术奥义，刺针术式、手法技术丰富多彩。
《杉山真传流针治手术详义》——传承了日本“针圣”杉山和一的管针术，历经几代针灸医家口耳相传，不断丰富完善，载录了杉山和一的主要管针操作术式及主治病证。
《针灸溯洄集》——日本江户时代一部简便实用的针灸学著作，倡导回归经典、研究古法、运用腹诊等。
《灸焫要览》——日本江户时期质量上乘的灸疗专著之一，艾灸理论与灸疗操作方法全面系统且独具特色。
《灸点图解》——香川流的重要灸法著作之一，内容精当而独具特色，其点穴施灸方法与施治经验值得学习参考。
《艾灸通说》——后藤流艾灸经验的总结之作，篇幅短小却字字珠玑。
《针灸则》——以临床疗效为依据，化繁为简，追求选穴施术简便实用。
《刺络编》_日本刺络法的代表著作之一，折衷中医经典《黄帝内经》所载刺络法与荷兰泻血法，凝聚中西刺络之精华，切合临床实用和实际操作。
《熙载录》——极为珍稀的刺络医案文献，系日本女针医垣本茂登辑录其父——日本著名刺络医家垣本针源的刺络验案集，为江户中期刺络疗法的代表著作之一。
《名家灸选三编》——日本江户后期灸疗专著的代表之作，重视特效灸法，广泛辑录中国医籍中记载的特效灸法，以及日本古传、俗传或名家所传的各种灸法治验，总计收载行之有效的灸法400余条，其中近一半是流传于日本本土的灸法治验，并形成了自身独特的灸治理论。
《针灸说约》——反映了针灸流派石坂流针术的主要技艺和特色，拔粹中西精要之法，附以个人独得之见，对针灸进行了日本式、实用性的阐释。
《困学穴法》——日本江户时代末期经穴学著作，大量汲取中国针灸医学的精华，同时渗透着日本本国特色。
《针论》——以《伤寒论》为本，用张仲景的理论指导针灸实践，临证取穴以疾病病位为主，重视临床实践，独树一帜，特色鲜明。
《百法针术》——记述了由杉山流鼻祖杉山和一口授，经其传人记录、保存、整理的百余种管针操作手技。
《针灸秘开》——集前代针灸医学之大成，折衷东西方之医学，汇集了作者40余年的针灸临证经验，具有鲜明的特色，成为玉森天心派的代表之作。
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