胡元会先后承担国家级课题2项，省部级2项，院级2项；现担任国家十一五支撑计划“冠心病、中风诊疗标准等中医技术标准示范研究”项目组组长，作为主持完成国家自然科学基金1项，北京市自然科学基金2项。其承担课题获2005年中华中医药科技进步一等奖1项（第3名）、2000年中国人民解放军科技进步二等奖1项（第3名）、1999年山东省教委实用新技术二等奖1项（第3名）。博士论文获山东省优秀毕业论文奖。先后发表论文50余篇，主编及参编学术著作8部。2006年获 “北京地区百名优秀青年医师”及“卫生系统先进个人”称号。